La Unión Sindical Obrera se estructura en 5 federaciones profesionales, que agrupan a la afiliación a partir de las secciones sindicales y que abarcan las principales áreas de actividad económica: Industria (FI-USO); Servicios (FS-USO); Atención a la Ciudadanía (FAC-USO); Enseñanza (FEUSO), y Seguridad Privada (FTSP-USO).
Las federaciones representan a su afiliación y sus representantes sindicales ante los poderes públicos, patronales e instituciones, y se encargan de realizar y promover la acción sindical y la negociación colectiva en su ámbito; se encargan del estudio de problemas sectoriales e intersectoriales y la propuesta de alternativas; de la resolución de conflictos entre organizaciones de su ámbito, así como de programar y realizar las elecciones sindicales, entre otras funciones.
